Winterterm 2007/08
Nichtlineare Dynamik und Selbstorganisation
Time : Wednesday 16:00 - 18:00
Begin : 17th October 2007 ; end: 13th February 2008
Place : SR 041 in BIOQUANT, INF 267
Lecturer: Matthias Weiss
IT-Methods for Systems Biologists
Block seminar, begin : 22nd Oct 2007 end : 9th Nov 2007
Time : 10:15 - 17:00
Place: BIOQUANT, INF 267
Nonlinear dynamics with applications to biological systems
Time : Tuesday 14:15 - 16:00
Place : SR 041 in BIOQUANT, INF 267
Lecturer: Ulrich Schwarz
Hauptpraktikum Systembiologie
Dynamische Modelle der Signaltransduktion und der Genregulation
Zeitraum: 19.11.2007 bis 07.12.2007
Inhalt des Praktikums:
Dieses Praktikum soll Studierenden der Bachelorstudiengänge Biologie, MZB und Molekulare Biotechnologie einen praktischen Zugang zur Systembiologie ermöglichen. Diese rapide wachsende neue Forschungsfeld an der Schnittstelle zwischen den Lebenswissenschaften und der Mathematik beschäftigt sich mit einem systemischen, modellbasierten Verständnis komplexer Prozesse in der Molekularen Zellbiologie.
In diesem Praktikum soll der gesamte Arbeitsbogen der Systembiologie vom Experiment bis zur quantitativen Datenerhebung, von der anschließenden Bildverarbeitung bis zur mathematischen Modellierung der beobachteten Prozesse im Kontext der Zellulären Entscheidungsprozesse abgedeckt werden.
Zelluläre Entscheidungen werden durch die gezielte Aktivierung von Signaltransduktions-Netzwerken und Genregulatorischen-Netzwerken gesteuert. Mittels Daten-basierte mathematischer Modellierung können Einblicke in Bauprinzipen und Steuermechanismen zellulärer Entscheidungsprozesse gewonnen werden. Am Beispiel der Signaltransduktion durch einen Zytokin-Rezeptor, den Erythropoietin Rezeptor, werden mittels quantitativem Immunblotting zeitaufgelöste Daten für die JAK2-STAT5 Signalkaskade generiert. Um zeitlich-räumliche Effekte zu adressieren wird die Mobilität von fluoreszenzmarkiertem STAT5 im Zellkern mittels FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching) am Konfokalmikroskop analysiert.
Im theoretischen Teil werden grundlegende Methoden der Bildverarbeitung und der mathematischen Modellierung von Diffusions-Reaktions-Prozessen behandelt und anhand der im Praktikum erhobenen Daten praktisch eingesetzt. Ziel des Praktikums ist es, sich für das hochmoderne und spannende Forschungsgebiet der Systembiologie zu qualifizieren.
Dozenten: Roland Eils, Thomas Höfer, Ursula Klingmüller, Ursula Kummer, Karl Rohr
Transportprozesse in biologischen Membranen
Eine interdisziplinäre Bioquant-Vorlesung
Die Vorlesungsreihe richtet sich insbesondere an Studenten im Hauptstudium und Doktoranden mit Interesse an der Modellierung und Simulation von biologischen Systemen. Sie informiert über die biologischen Grundlagen und die Konzepte der mathematischen Modellierung und Simulation der Prozesse in Membranen. Aktuelle Informationen
Termin: Montag 16:00 - 18:00
Veranstaltungsort: Seminarraum 044, INF 267 (BIOQUANT)
Dozent: Dr. Maria Neuss-Radu
Theory of soft and biomatter
Termin: Dienstag 14:15 - 15:45
Veranstaltungsort: Hörsaal im Erdgeschoss, INF 267 (BIOQUANT)
Dozent: Dr. Ulrich Schwarz
Oberseminar: Current topics in Cellular Biophysics
Termin: Mittwoch 16:15 - 17:45
Veranstaltungsort: Hösaal im Erdgeschoss, INF 267 (BIOQUANT)
Dozenten: Dr. Francois Nedelec, Dr. Ulrich Schwarz, Dr. Matthias Weiss